Dr. José Isidro Bonifaz, Licenciado, Clérigo y Político: Primer Rector (Director) del C.N. San Juan; fué rector de la UNT (desde 1851), comenzó afunciar en el local de la Universidad, el 23 de Agosto de 1854. Gran papel desempeñó el Vice Rector don José María Arbaiza en la labor directríz del C.N. San Juan(”instituto Nacional de Ciencias de Trujillo” por entonces).
Dr. José Nicolás Rebaza Cueto, Rector UNT, Maestro ejemplar del C.N. San Juan, fundador del colegio San Nicolás de Huamachuco, su tierra. Obra: Anales del departamento de La Libertad en la Guerra de la Independencia, con prólogo de Ricardo Palma.
Dr. Carlos A. Washburn, Sub-Director y Profesor del C.N. San Juan, Rector UNT, Presidente del Consejo de Ministros y Ministro de Justicia en el Gobierno del Presidente José Pardo.
Dr. Pedro M. Ureña, Alumno, Profesor e Inspector del C.N. San Juan, Rector UNT(1906-1909). Alcalde de la Municipalidad Provincial de Trujillo, y Diputado.
Dr. José María Checa, Maestro, Escritor y Abogado. Fué Profesor y Director del C.N. San Juan desde 1885 hasta 1906; Vice-Rector (1906-1909) y Rector UNT (1909-1918), Presidente de la Corte Superior de Justicia de La Libertad
Dr. Pedro Rivadeneyra, Profesor del C.N. San Juan desde 1885 a 1906, Vice-Presidente de la Camara de Diputados. Ejerció con probidad 50 años de vida pública. Murió siendo Rector el 18/09/1920.
Dr. Carlos E. Uceda Meza, Santiaguino (1872), estudio en el C.N. San Juan, profesor y Regente del “Instituto Moderno”, Rector UNT (1992- 1930), Diputado, murió el 26 febrero de 1932.
Dr. Masías D. Sánchez, Profesor del C.N. San Juan, Rector - Presidente de la junta Reorganizadora de la UNT en 1945. Alcalde de Trujillo, Decano del Colegio de Abogados de La Libertad
Dr. Alvaro Pinillos Goicochea, estudió primaria y secundaria en el C.N. San Juan, Presidente de la FUT (1920) y fundador de la FEP; Diputado (1929), Profesor del C.N. San Juan, Catedrático y Presidente de la Junta Reorganizadora de la UNT (1949).
Dr. Julio Quevedo Lizarzaburu, Catedrático y Presidente de Junta Reorganizadora de la UNT(1948), estudio en el C.N. San Juan.
Dr. Virgilio Vanini de los Ríos, estudiío en el C.N. San Juan (promoción 1936), Decano del Colegio de Abogados de La Libertad, Alcalde de Trujillo, Vice Rector(1957 - 1961) y Rector (1961 - 1966).
Dr. Jorge Ruíz Dávila, estudió en el C.N. San Juan (promoción 1960), Rector (1990 - 1995), Congresista de la República (1995 - 2000).